 Gemeinnütziges InstitutAlfried Krupp Wissenschaftskolleg Greifswald | Greifswald | Mecklenburg-Vorpommern | 2000 | |
 Gemeinnütziges InstitutArbeitsgemeinschaft für zeitgemäßes Bauen | Kiel | Schleswig-Holstein | 1946 | |
| Gemeinnütziges InstitutAWS-Institut für digitale Produkte und Prozesse | Saarbrücken | Saarland | 2014 | |
 Gemeinnütziges InstitutBayerisches Zentrum für Angewandte Energieforschung | Würzburg | Bayern | 1991 | |
| Gemeinnütziges InstitutBiologische Station Witten | Witten | Nordrhein-Westfalen | 1985 | |
 Gemeinnütziges InstitutCenter for Advanced Internet StudiesCAIS | Bochum | Nordrhein-Westfalen | 2021 | |
| Gemeinnütziges InstitutCollegium Carolinum | München | Bayern | 1956 | |
 Gemeinnütziges InstitutDECHEMA-Forschungsinstitut | Bad Homburg vor der Höhe | Hessen | 1961 | |
 Gemeinnütziges InstitutDeutsches Maritimes InstitutDMI | Wilhelmshaven | Niedersachsen | 1973 | |
| Gemeinnütziges InstitutDeutsches Steuerzahlerinstitut | Berlin | Berlin | 1965 | |
| Gemeinnütziges InstitutDeutsches Zentrum für Infektionsforschung | Braunschweig | Niedersachsen | 2012 | |
| Gemeinnütziges InstitutDeutsches Zentrum für Integrations- und Migrationsforschung | Berlin | Berlin | 2017 | |
 Gemeinnütziges InstitutErich Pommer Institut | Potsdam | Brandenburg | 1998 | |
| Gemeinnütziges InstitutEuropäisches Institut für Journalismus- und KommunikationsforschungEIJK | Leipzig | Sachsen | — | |
| Gemeinnütziges InstitutEuropäisches Zentrum für MinderheitenfragenECMI | Flensburg | Schleswig-Holstein | 1996 | |
| Gemeinnütziges InstitutFEhS-Institut für Baustoff-Forschung | Duisburg | Nordrhein-Westfalen | — | |
| Gemeinnütziges InstitutFIR | Aachen | Nordrhein-Westfalen | 1953 | |
| Gemeinnütziges InstitutForschungsgemeinschaft Werkzeuge und WerkstoffeFGW | Remscheid | Nordrhein-Westfalen | 1952 | |
| Gemeinnütziges InstitutForschungsgesellschaft Landschaftsentwicklung LandschaftsbauFLL | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1975 | |
| Gemeinnütziges InstitutForschungsinstitut Betriebliche Bildung | Nürnberg | Bayern | 2003 | |
 Gemeinnütziges InstitutForschungsinstitut für Leder und KunststoffbahnenFILK | Freiberg | Sachsen | 1938 | |
| Gemeinnütziges InstitutForschungsinstitut für pflanzenbasierte Ernährung (IFPE) gGmbH | Biebertal | Hessen | — | |
 Gemeinnütziges InstitutForschungsstelle für Energiewirtschaft | München | Bayern | — | |
| Gemeinnütziges InstitutForschungsstelle für Zeitgeschichte in Hamburg | Hamburg | Hamburg | 1997 | |
 Gemeinnütziges InstitutForschungsverbund Berlin | Berlin | Berlin | 1992 | |
| Gemeinnütziges InstitutFZI Forschungszentrum InformatikFZI | Karlsruhe | Baden-Württemberg | 1985 | |
 Gemeinnütziges InstitutGauss Centre for Supercomputing | Berlin | Berlin | 2007 | |
| Gemeinnütziges InstitutGeisteswissenschaftliche Zentren Berlin | Berlin | Berlin | — | |
| Gemeinnütziges InstitutGreifenberger Institut für Musikinstrumentenkunde gGmbH | Greifenberg | Bayern | — | |
 Gemeinnütziges InstitutHamburger Institut für Sozialforschung | Hamburg | Hamburg | 1984 | |
 Gemeinnütziges InstitutHeidelberger Institut für Internationale Konfliktforschung | Heidelberg | Baden-Württemberg | 1991 | |
| Gemeinnütziges InstitutHeidelberger Institut für Theoretische Studien | Heidelberg | Baden-Württemberg | — | |
 Gemeinnütziges InstitutHelmholtz-Gemeinschaft Deutscher ForschungszentrenHGF | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 2001 | |
| Gemeinnütziges InstitutICM Chemnitz | Chemnitz | Sachsen | 1992 | |
| Gemeinnütziges InstitutIfM - Institut für Musikinstrumentenbau e.V. | Klingenthal | Sachsen | — | |
| Gemeinnütziges InstitutIKT – Institut für Unterirdische InfrastrukturIKT | Gelsenkirchen | Nordrhein-Westfalen | 1994 | |
 Gemeinnütziges InstitutInstitut für angewandte Forschung Berlin | Berlin | Berlin | 2009 | |
 Gemeinnütziges InstitutInstitut für Automation und Kommunikation | Magdeburg | Sachsen-Anhalt | 1991 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für Forschungsinformation und Qualitätssicherung | Berlin | Berlin | 2005 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für Gerontologische Forschung | Berlin | Berlin | 1985 | |
 Gemeinnütziges InstitutInstitut für Luft- und KältetechnikILK | Dresden | Sachsen | 1990 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für Molekulare Biologie | Mainz | Rheinland-Pfalz | 2010 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für Sächsische Geschichte und VolkskundeISGV | Dresden | Sachsen | 1997 | |
 Gemeinnütziges InstitutInstitut für Sozialforschung | Frankfurt am Main | Hessen | 1923 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für Umwelt & Energie, Technik & AnalytikIUTA | Duisburg | Nordrhein-Westfalen | 1989 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für UnternehmenskybernetikIfU | Aachen | Nordrhein-Westfalen | 1988 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für ZukunftsEnergieSysteme | Saarbrücken | Saarland | 1999 | |
| Gemeinnütziges InstitutISF München | München | Bayern | 1965 | |
| Gemeinnütziges InstitutKommission für Geschichte des Parlamentarismus und der politischen Parteien | Berlin | Berlin | 1951 | |
| Gemeinnütziges InstitutKonsortium Deutsche Meeresforschung | Berlin | Berlin | 2004 | |
 Gemeinnütziges InstitutKulturstiftung Sibirien | Fürstenberg/Havel | Brandenburg | 2010 | |
| Gemeinnütziges InstitutLaser-Laboratorium Göttingen | Göttingen | Niedersachsen | 1987 | |
| Gemeinnütziges InstitutLaser Zentrum Hannover | Hannover | Niedersachsen | 1986 | |
| Gemeinnütziges InstitutLehr- und Versuchsanstalt für Gartenbau und Arboristik e.V. - Obstbau-Versuchsstation Müncheberg | Müncheberg | Brandenburg | — | |
| Gemeinnütziges InstitutLeibniz-Institut für Medienforschung | Hans-Bredow-Institut (HBI) | Hamburg | Hamburg | 1950 | |
| Gemeinnütziges InstitutMax-Reger-Institut | Karlsruhe | Baden-Württemberg | — | |
| Gemeinnütziges InstitutMedizinische Enzym- Forschungs-Gesellschaft e.V. | Grassau | Bayern | — | |
| Gemeinnütziges InstitutModellfabrik Papier | Düren | Nordrhein-Westfalen | 2021 | |
 Gemeinnütziges InstitutNürnberg Institut für Marktentscheidungen | Nürnberg | Bayern | 1934 | |
| Gemeinnütziges InstitutParmenides Foundation | Pöcking | Bayern | 2000 | |
 Gemeinnütziges InstitutStudiengesellschaft für den Kombinierten VerkehrSGKV | Berlin | Berlin | 1928 | |
 Gemeinnütziges InstitutSüdwind-Institut | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1991 | |
| Gemeinnütziges InstitutSylvia Lawry Centre for MS Research e.V. | München | Bayern | 2001 | |
 Gemeinnütziges InstitutVerein zur Förderung eines Deutschen ForschungsnetzesDFN | Berlin | Berlin | 1984 | |
 Gemeinnütziges InstitutVersuchs- und Lehranstalt für BrauereiVLB | Berlin | Berlin | 1883 | |
| Gemeinnütziges InstitutWeizenbaum-Institut | Berlin | Berlin | 2017 | |
| Gemeinnütziges InstitutWilhelm-Röpke-Institut | Erfurt | Thüringen | 2007 | |
 Gemeinnütziges InstitutWuppertal Institut für Klima, Umwelt, Energie | Wuppertal | Nordrhein-Westfalen | 1990 | |
| Gemeinnütziges InstitutZentrum für Osteuropa- und internationale StudienZOiS | Berlin | Berlin | 2016 | |