 HelmholtzAlfred-Wegener-InstitutAWI | Bremerhaven | Bremen | 1980 | |
| HelmholtzCISPA - Helmholtz-Zentrum für InformationssicherheitCISPA | Saarbrücken | Saarland | 2011 | |
 HelmholtzDeutsches Elektronen-SynchrotronDESY | Hamburg | Hamburg | 1959 | |
 HelmholtzDeutsches KrebsforschungszentrumDKFZ | Heidelberg | Baden-Württemberg | 1964 | |
 HelmholtzDeutsches Zentrum für Luft- und RaumfahrtDLR | Köln | Nordrhein-Westfalen | 1907 | |
 HelmholtzDeutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 2009 | |
| HelmholtzErnst Ruska-Centrum | Jülich | Nordrhein-Westfalen | 2004 | |
 HelmholtzEuropean XFEL | Schenefeld | Schleswig-Holstein | — | |
 HelmholtzForschungszentrum JülichFZJ | Jülich | Nordrhein-Westfalen | 1956 | 1 |
 HelmholtzGFZ Helmholtz-Zentrum für GeoforschungGFZ | Potsdam | Brandenburg | 1992 | |
 HelmholtzGSI Helmholtzzentrum für SchwerionenforschungGSI | Darmstadt | Hessen | 1969 | |
| HelmholtzHelmholtz Alliance for Astroparticle Physics | Karlsruhe | Baden-Württemberg | 2011 | |
| HelmholtzHelmholtz Alliance Imaging and Curing Environmental Metabolic Diseases | Garching bei München | Bayern | — | |
| HelmholtzHelmholtz Graduate School for Hadron and Ion Research | Frankfurt am Main | Hessen | — | |
| HelmholtzHelmholtz-Institut für Funktionelle Marine Biodiversität an der Universität Oldenburg | Oldenburg | Niedersachsen | 2017 | |
| HelmholtzHelmholtz-Institut für Translationale Onkologie (HI-TRON, Mainz) | Mainz | Rheinland-Pfalz | 2019 | |
 HelmholtzHelmholtz-Institut Ulm | Ulm | Baden-Württemberg | 2011 | |
| HelmholtzHelmholtz International Center for FAIR | Frankfurt am Main | Hessen | 2008 | |
 HelmholtzHelmholtz-Zentrum Berlin für Materialien und EnergieHZB | Berlin | Berlin | 2009 | |
 HelmholtzHelmholtz-Zentrum Dresden-RossendorfHZDR | Dresden | Sachsen | 1992 | |
 HelmholtzHelmholtz-Zentrum für InfektionsforschungHZI | Braunschweig | Niedersachsen | 1965 | |
| HelmholtzHelmholtz-Zentrum für Ozeanforschung KielGEOMAR | Kiel | Schleswig-Holstein | 2012 | |
 HelmholtzHelmholtz-Zentrum für Umweltforschung – UFZUFZ | Leipzig | Sachsen | 1991 | |
| HelmholtzHelmholtz-Zentrum Hereon | Geesthacht | Schleswig-Holstein | 1956 | |
| HelmholtzHelmholtz-Zentrum HereonHereon | Geesthacht | Schleswig-Holstein | 1956 | |
 HelmholtzHelmholtz-Zentrum München | Oberschleißheim | Bayern | 1964 | |
 HelmholtzKarlsruher Institut für TechnologieKIT | Karlsruhe | Baden-Württemberg | 2009 | 4 |
 HelmholtzMax-Delbrück-Centrum für Molekulare MedizinMDC | Berlin | Berlin | 1992 | |
| HelmholtzMax PlanckMax-Planck-Institut für PlasmaphysikIPP | Garching bei München | Bayern | 1960 | |