| ForschungsinstitutAachener Kompetenzzentrum Wissenschaftsgeschichte | Aachen | Nordrhein-Westfalen | 2006 | |
| ForschungsinstitutAEG-Büro- und Laborgebäude | Berlin | Berlin | 1940 | |
| Hochschulnahe EinrichtungAfrica Multiple: Afrikastudien neu gestalten | Bayreuth | Bayern | 2019 | |
| DenkfabrikAgora Verkehrswende | Berlin | Berlin | — | |
| ForschungsinstitutAlbertus-Magnus-Institut | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1931 | |
| ForschungsinstitutAlemannisches Institut | Freiburg im Breisgau | Baden-Württemberg | 1931 | |
 ForschungsinstitutAlexander von Humboldt Institut für Internet und GesellschaftHIIG | Berlin | Berlin | 2012 | |
 Gemeinnütziges InstitutAlfried Krupp Wissenschaftskolleg Greifswald | Greifswald | Mecklenburg-Vorpommern | 2000 | |
| ForschungsinstitutAllianz Zentrum für TechnikAZT | Ismaning | Bayern | — | |
| ForschungsinstitutAmerican Academy in Berlin | Berlin | Berlin | 1994 | |
 Gemeinnütziges InstitutArbeitsgemeinschaft für zeitgemäßes Bauen | Kiel | Schleswig-Holstein | 1946 | |
 Hochschulnahe EinrichtungArbeitsstelle für linguistische Gesellschaftsforschung | Magdeburg | Sachsen-Anhalt | — | |
| Hochschulnahe EinrichtungArbeitsstelle für Technikgeschichte | Leipzig | Sachsen | — | |
| Hochschulnahe EinrichtungArbeitsstelle Pädagogische Lesungen | Rostock | Mecklenburg-Vorpommern | — | |
| ForschungsanlageAstronomisches Rechen-Institut | Heidelberg | Baden-Württemberg | 1700 | |
 DenkfabrikAtlantik-Brücke | Berlin | Berlin | 1952 | |
| DenkfabrikAtlantische Initiative | Berlin | Berlin | 2004 | |
| Gemeinnütziges InstitutAWS-Institut für digitale Produkte und Prozesse | Saarbrücken | Saarland | 2014 | |
| ForschungsinstitutBarkhausen Institut | Dresden | Sachsen | 2017 | |
 DenkfabrikBauhaus Luftfahrt | Taufkirchen | Bayern | 2005 | |
| LandeseinrichtungBayerische Landesanstalt für Wald und Forstwirtschaft | Freilassing | Bayern | 1881 | |
| ForschungsinstitutBayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie | München | Bayern | 2000 | |
 Akademie-InstitutBayerisches Forschungsinstitut für Digitale Transformationbidt | München | Bayern | 2018 | |
| LandeseinrichtungBayerisches Landesamt für Umwelt | Augsburg | Bayern | 2005 | |
 Gemeinnütziges InstitutBayerisches Zentrum für Angewandte Energieforschung | Würzburg | Bayern | 1991 | |
 ForschungsinstitutBerlin-Brandenburger Centrum für Regenerative Therapien | Berlin | Berlin | 2006 | |
 DenkfabrikBerlin Governance Platform | Berlin | Berlin | 2014 | |
 DenkfabrikBerlin-Institut für Bevölkerung und Entwicklung | Berlin | Berlin | 2000 | |
| ForschungsinstitutBerliner Informationszentrum für Transatlantische Sicherheit | Berlin | Berlin | 1991 | |
| ForschungsinstitutBernstein Center for Computational Neuroscience Tübingen | Tübingen | Baden-Württemberg | 2010 | |
| ForschungsinstitutBienenkundemuseum Münstertal | Münstertal/Schwarzwald | Baden-Württemberg | 1978 | |
| ForschungsinstitutBiologische Anstalt Helgoland | Helgoland | Schleswig-Holstein | 1892 | |
| Gemeinnütziges InstitutBiologische Station Witten | Witten | Nordrhein-Westfalen | 1985 | |
| ForschungsinstitutBioökonomiezentrum Anklam | Murchin | Mecklenburg-Vorpommern | — | |
 ForschungsinstitutBonn International Centre for Conflict StudiesBICC | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1994 | |
| ForschungsinstitutBremer Institut für angewandte Strahltechnik | Bremen | Bremen | 1977 | |
 BundeseinrichtungBundesanstalt für Geowissenschaften und RohstoffeBGR | Hannover | Niedersachsen | 1958 | |
 BundeseinrichtungBundesanstalt für GewässerkundeBfG | Koblenz | Rheinland-Pfalz | 1949 | |
 BundeseinrichtungBundesanstalt für Materialforschung und -prüfungBAM | Berlin | Berlin | 1871 | |
 BundeseinrichtungBundesanstalt für Straßen- und VerkehrswesenBASt | Bergisch Gladbach | Nordrhein-Westfalen | 1951 | |
 BundeseinrichtungBundesanstalt für WasserbauBAW | Karlsruhe | Baden-Württemberg | 1948 | |
 BundeseinrichtungBundesinstitut für BerufsbildungBIBB | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1970 | |
 BundeseinrichtungBundesinstitut für BevölkerungsforschungBIB | Wiesbaden | Hessen | 1973 | |
 BundeseinrichtungBundesinstitut für Kultur und Geschichte der Deutschen im östlichen EuropaBKGE | Oldenburg | Niedersachsen | 1989 | |
 BundeseinrichtungBundesinstitut für RisikobewertungBfR | Berlin | Berlin | 2002 | |
 BundeseinrichtungBundesinstitut für SportwissenschaftBISp | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1970 | |
| ForschungsinstitutCafé Luitpold | München | Bayern | — | |
 ForschungsinstitutCASED | Darmstadt | Hessen | 2008 | |
 ForschungsinstitutCBS International Business School | Köln | Nordrhein-Westfalen | 1993 | |
| ForschungsinstitutCeNTech | Münster | Nordrhein-Westfalen | 2001 | |
 Gemeinnütziges InstitutCenter for Advanced Internet StudiesCAIS | Bochum | Nordrhein-Westfalen | 2021 | |
| Hochschulnahe EinrichtungCenter for Advancing Electronics Dresden | Dresden | Sachsen | 2012 | |
 ForschungsinstitutCenter for Financial Studies | Frankfurt am Main | Hessen | 1967 | |
| ForschungsinstitutCenter for Integrated Protein Science Munich | München | Bayern | 2006 | |
| Hochschulnahe EinrichtungCenter for Molecular and Cellular BioengineeringCMCB | Dresden | Sachsen | 2016 | |
| ForschungsinstitutCenter for NanoScience | München | Bayern | 1998 | |
| DenkfabrikCentre for Humanitarian ActionCHA | Berlin | Berlin | 2018 | |
| ForschungsinstitutCentre Marc Bloch | Berlin | Berlin | 1992 | |
| DenkfabrikCentrum für angewandte Politikforschung | München | Bayern | 1995 | |
 DenkfabrikCentrum für Europäische Politik | Freiburg im Breisgau | Baden-Württemberg | 2006 | |
 Hochschulnahe EinrichtungClausthaler Forschungszentrum für Rohstoffsicherung und Ressourceneffizienz | Clausthal-Zellerfeld | Niedersachsen | 1990 | |
| ForschungsinstitutClimate Service Center | Hamburg | Hamburg | — | |
| Gemeinnütziges InstitutCollegium Carolinum | München | Bayern | 1956 | |
| Akademie-InstitutCologne Center for eHumanities | Köln | Nordrhein-Westfalen | 2009 | |
| Hochschulnahe EinrichtungCologne Game LabCGL | Köln | Nordrhein-Westfalen | 2010 | |
| Hochschulnahe EinrichtungConservation Biogeography Lab | Berlin | Berlin | — | |
| ForschungsinstitutCVMA Potsdam | Potsdam | Brandenburg | 1956 | |
 DenkfabrikD64 – Zentrum für digitalen Fortschritt | Berlin | Berlin | 2011 | |
 Gemeinnütziges InstitutDECHEMA-Forschungsinstitut | Bad Homburg vor der Höhe | Hessen | 1961 | |
| ForschungsinstitutDeutsch-Französisches Institut | Ludwigsburg | Baden-Württemberg | 1948 | |
 DenkfabrikDeutsche Gesellschaft für Auswärtige Politik | Berlin | Berlin | 1955 | |
 DenkfabrikDeutsche Gesellschaft für Personalführung | Berlin | Berlin | 1952 | |
 BundeseinrichtungDeutsches Archäologisches InstitutDAI | Berlin | Berlin | 1829 | |
 ForschungsinstitutDeutsches Forschungszentrum für Künstliche IntelligenzDFKI | Kaiserslautern | Rheinland-Pfalz | 1988 | |
| ForschungsinstitutDeutsches Institut für VolksumfragenDivo | Frankfurt am Main | Hessen | 1951 | |
 Gemeinnütziges InstitutDeutsches Maritimes InstitutDMI | Wilhelmshaven | Niedersachsen | 1973 | |
| ForschungsinstitutDeutsches NotarinstitutDNotI | Würzburg | Bayern | 1993 | |
| Gemeinnütziges InstitutDeutsches Steuerzahlerinstitut | Berlin | Berlin | 1965 | |
| ForschungsinstitutDeutsches Zentrum für Diabetesforschung | Oberschleißheim | Bayern | — | |
| Gemeinnütziges InstitutDeutsches Zentrum für Infektionsforschung | Braunschweig | Niedersachsen | 2012 | |
| Gemeinnütziges InstitutDeutsches Zentrum für Integrations- und Migrationsforschung | Berlin | Berlin | 2017 | |
| ForschungsinstitutDeutsches Zentrum für integrative Biodiversitätsforschung | Leipzig | Sachsen | — | |
| BundeseinrichtungDeutsches Zentrum für SchienenverkehrsforschungDZSF | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 2019 | |
| ForschungsinstitutDoerner Institut | München | Bayern | 1937 | |
| ForschungsinstitutDr. Margarete Fischer-Bosch - Institut für Klinische Pharmakologie | Stuttgart | Baden-Württemberg | — | |
| ForschungsinstitutDZHW - Deutsches Zentrum für Hochschul- und WissenschaftsforschungDZHW | Hannover | Niedersachsen | 2013 | |
| ForschungsinstitutE-Finance Lab | Frankfurt am Main | Hessen | 2003 | |
| ForschungsinstitutEcolog-Institut | Lüneburg | Niedersachsen | — | |
| DenkfabrikEHI Retail InstituteEHI | Köln | Nordrhein-Westfalen | — | |
| ForschungsinstitutEinstein-Elevator | Hannover | Niedersachsen | 2016 | |
 ForschungsinstitutEnergie Campus Nürnberg | Nürnberg | Bayern | — | |
 An-InstitutEnergiewirtschaftliches Institut an der Universität zu KölnEWI | Köln | Nordrhein-Westfalen | 1943 | |
| DenkfabrikEntwicklungsagentur Rheinland-PfalzEA | Kaiserslautern | Rheinland-Pfalz | 2003 | |
| ForschungsinstitutEnvihab | Köln | Nordrhein-Westfalen | 2012 | |
 Gemeinnütziges InstitutErich Pommer Institut | Potsdam | Brandenburg | 1998 | |
| ForschungsinstitutErwin L. Hahn Institute for Magnetic Resonance Imaging | Essen | Nordrhein-Westfalen | 2005 | |
| Hochschulnahe EinrichtungEuropa-Institut Saarbrücken | Saarbrücken | Saarland | 1951 | |
 Akademie-InstitutEuropäische Akademie der ArbeitEAdA | Frankfurt am Main | Hessen | 1921 | |
 ForschungsanlageEuropäische Südsternwarte | Garching bei München | Bayern | 1962 | |
| ForschungsinstitutEuropäisches Institut für internationale Wirtschaftsbeziehungen | Wuppertal | Nordrhein-Westfalen | 1996 | |
| Gemeinnütziges InstitutEuropäisches Institut für Journalismus- und KommunikationsforschungEIJK | Leipzig | Sachsen | — | |
| Hochschulnahe EinrichtungEuropäisches Romanik ZentrumERZ | Merseburg | Sachsen-Anhalt | 2006 | |
| Gemeinnütziges InstitutEuropäisches Zentrum für MinderheitenfragenECMI | Flensburg | Schleswig-Holstein | 1996 | |
| ForschungsinstitutEuropean Banking Institute (EBI) | Frankfurt am Main | Hessen | — | |
| ForschungsinstitutEuropean Forest Institute | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1993 | |
| ForschungsinstitutEuropean Molecular Biology LaboratoryLEBM | Heidelberg | Baden-Württemberg | 1974 | |
| Akademie-InstitutEvangelische Akademie Tutzing | Tutzing | Bayern | 1947 | |
| ForschungsinstitutExtreMe Matter Institute | Darmstadt | Hessen | — | |
 ForschungsinstitutExzellenzcluster „Asien und Europa im globalen Kontext“ | Heidelberg | Baden-Württemberg | 2007 | |
 ForschungsinstitutEyvor Institut | Hamburg | Hamburg | 2018 | |
 ForschungsinstitutFacility for Antiproton and Ion Research | Darmstadt | Hessen | 2010 | |
| ForschungsinstitutFallturm Bremen | Bremen | Bremen | — | |
| Gemeinnütziges InstitutFEhS-Institut für Baustoff-Forschung | Duisburg | Nordrhein-Westfalen | — | |
| Gemeinnütziges InstitutFIR | Aachen | Nordrhein-Westfalen | 1953 | |
 Forschungsinstitutforsa | Berlin | Berlin | 1984 | |
| ForschungsanlageForschungs-Neutronenquelle Heinz Maier-Leibnitz | Garching bei München | Bayern | — | |
| ForschungsinstitutForschungseinrichtung für experimentelle Medizin | Berlin | Berlin | 1981 | |
| Gemeinnütziges InstitutForschungsgemeinschaft Werkzeuge und WerkstoffeFGW | Remscheid | Nordrhein-Westfalen | 1952 | |
| Gemeinnütziges InstitutForschungsgesellschaft Landschaftsentwicklung LandschaftsbauFLL | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1975 | |
| Akademie-InstitutForschungsinstitut an der Diabetes-Akademie Bad Mergentheim | Bad Mergentheim | Baden-Württemberg | 1983 | |
| Gemeinnütziges InstitutForschungsinstitut Betriebliche Bildung | Nürnberg | Bayern | 2003 | |
| ForschungsinstitutForschungsinstitut Bioaktive Polymersysteme | Teltow | Brandenburg | 1996 | |
| Hochschulnahe EinrichtungForschungsinstitut für Diskrete Mathematik | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1988 | |
| ForschungsinstitutForschungsinstitut für Edelmetalle und Metallchemiefem | Schwäbisch Gmünd | Baden-Württemberg | 1922 | |
| ForschungsinstitutForschungsinstitut für Kinderernährung | Dortmund | Nordrhein-Westfalen | 1964 | |
 Gemeinnütziges InstitutForschungsinstitut für Leder und KunststoffbahnenFILK | Freiberg | Sachsen | 1938 | |
| Hochschulnahe EinrichtungForschungsinstitut für MusiktheaterFIMT | Thurnau | Bayern | 1976 | |
 ForschungsinstitutForschungsinstitut für NachhaltigkeitRIFS | Potsdam | Brandenburg | 2009 | |
| ForschungsinstitutForschungsinstitut für Nutztierbiologie | Dummerstorf | Mecklenburg-Vorpommern | — | |
| Gemeinnütziges InstitutForschungsinstitut für pflanzenbasierte Ernährung (IFPE) gGmbH | Biebertal | Hessen | — | |
| ForschungsinstitutForschungsinstitut für Philosophie Hannover | Hannover | Niedersachsen | 1988 | |
 DenkfabrikForschungsinstitut zur Zukunft der Arbeit | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1998 | |
| ForschungsinstitutForschungskreis der ErnährungsindustrieFEI | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1953 | |
| ForschungsanlageForschungsreaktor MünchenFRM | Garching bei München | Bayern | — | |
| Hochschulnahe EinrichtungForschungsstation Gülpe | Havelaue | Brandenburg | 1978 | |
 Gemeinnütziges InstitutForschungsstelle für Energiewirtschaft | München | Bayern | — | |
| Gemeinnütziges InstitutForschungsstelle für Zeitgeschichte in Hamburg | Hamburg | Hamburg | 1997 | |
 Gemeinnütziges InstitutForschungsverbund Berlin | Berlin | Berlin | 1992 | |
| Hochschulnahe EinrichtungForschungszentrum Küste | Hannover | Niedersachsen | 1996 | |
 ForschungsinstitutForstliche Versuchs- und Forschungsanstalt Baden-Württemberg | Freiburg im Breisgau | Baden-Württemberg | 1958 | |
 DenkfabrikForum Ökologisch-Soziale Marktwirtschaft | Berlin | Berlin | 1994 | |
| ForschungsinstitutForWind – Zentrum für Windenergieforschung | Oldenburg | Niedersachsen | 2003 | |
| ForschungsinstitutFrankfurt Cancer Institute | Frankfurt am Main | Hessen | — | |
| ForschungsinstitutFrankfurt Institute for Advanced Studies | Frankfurt am Main | Hessen | — | |
| ForschungsinstitutFraunhofer-Institut für Translationale Medizin und PharmakologieFraunhofer ITMP | Frankfurt am Main | Hessen | 2021 | |
| ForschungsinstitutFraunhofer IVV, Außenstelle für Verarbeitungsmaschinen und Verpackungstechnik | Dresden | Sachsen | — | |
| ForschungsinstitutFraunhofer-Verbund Mikroelektronik | Berlin | Berlin | 1996 | |
| ForschungsinstitutFraunhofer-Zentrum für Chemisch-Biotechnologische ProzesseFraunhofer CBP | Leuna | Sachsen-Anhalt | — | |
| ForschungsinstitutFreiburger Institut für Musikermedizin | Freiburg im Breisgau | Baden-Württemberg | 2005 | |
 BundeseinrichtungFriedrich-Loeffler-InstitutFLI | Greifswald | Mecklenburg-Vorpommern | 1910 | |
| ForschungsinstitutFrobenius-Institut | Frankfurt am Main | Hessen | 1898 | |
| ForschungsmuseumFuturium | Berlin | Berlin | — | |
| Gemeinnütziges InstitutFZI Forschungszentrum InformatikFZI | Karlsruhe | Baden-Württemberg | 1985 | |
 Gemeinnütziges InstitutGauss Centre for Supercomputing | Berlin | Berlin | 2007 | |
| Gemeinnütziges InstitutGeisteswissenschaftliche Zentren Berlin | Berlin | Berlin | — | |
| LandeseinrichtungGeologischer Dienst für Bremen | Bremen | Bremen | 2008 | |
 ForschungsinstitutGeorg-Speyer-Haus | Frankfurt am Main | Hessen | 1904 | |
 Akademie-InstitutGeorg-von-Vollmar-Akademie | Kochel am See | Bayern | 1948 | |
 ForschungsinstitutGeorge C. Marshall Europäisches Zentrum für SicherheitsstudienGCMC | Garmisch-Partenkirchen | Bayern | 1993 | |
 ForschungsinstitutGerman Institute for Defence and Strategic StudiesGIDS | Hamburg | Hamburg | 2018 | |
 DenkfabrikGerman Institute of Development and Sustainability (IDOS)IDOS | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1964 | |
| ForschungsinstitutGesellschaft für Angewandte Medizinische Physik und TechnikGAMPT | Merseburg | Sachsen-Anhalt | 1998 | |
| DenkfabrikGesellschaft für Internationale FriedenspolitikGIF | Eschwege | Hessen | 2015 | |
 DenkfabrikGlobal Public Policy Institute | Berlin | Berlin | 2003 | |
| DenkfabrikGlobal Solutions Initiative | Berlin | Berlin | 2017 | |
| ForschungsinstitutGöttinger Institut für Demokratieforschung | Göttingen | Niedersachsen | 2010 | |
 ForschungsinstitutGraduate School of Economics, Finance, and Management | Frankfurt am Main | Hessen | 2008 | |
| Gemeinnütziges InstitutGreifenberger Institut für Musikinstrumentenkunde gGmbH | Greifenberg | Bayern | — | |
| ForschungsinstitutGreifswald Moor CentrumGMC | Greifswald | Mecklenburg-Vorpommern | 2015 | |
| ForschungsinstitutHamburg Center for Health Economics | Hamburg | Hamburg | 2010 | |
 Gemeinnütziges InstitutHamburger Institut für Sozialforschung | Hamburg | Hamburg | 1984 | |
 An-InstitutHasso-Plattner-InstitutHPI | Potsdam | Brandenburg | 1998 | |
 DenkfabrikHaus Rissen Hamburg – Institut für Internationale Politik und Wirtschaft | Hamburg | Hamburg | 1954 | |
 ForschungsinstitutHausdorff Center for Mathematics | Bonn | Nordrhein-Westfalen | — | |
| ForschungsinstitutHearing4all | Oldenburg | Niedersachsen | — | |
 Gemeinnütziges InstitutHeidelberger Institut für Internationale Konfliktforschung | Heidelberg | Baden-Württemberg | 1991 | |
| Gemeinnütziges InstitutHeidelberger Institut für Theoretische Studien | Heidelberg | Baden-Württemberg | — | |
 Gemeinnütziges InstitutHelmholtz-Gemeinschaft Deutscher ForschungszentrenHGF | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 2001 | |
 ForschungsinstitutHelmholtz-Institut Erlangen-Nürnberg für Erneuerbare EnergienHI ERN | Erlangen | Bayern | 2013 | |
 ForschungsinstitutHelmholtz-Institut Freiberg für RessourcentechnologieHIF | Freiberg | Sachsen | 2011 | |
| ForschungsinstitutHelmholtz-Institut für Pharmazeutische Forschung Saarland (HIPS) | Saarbrücken | Saarland | — | |
| ForschungsinstitutHelmholtz-Institut für RNA-basierte Infektionsforschung | Würzburg | Bayern | 2017 | |
| ForschungsinstitutHelmholtz-Institut Jena | Jena | Thüringen | 2009 | |
| ForschungsinstitutHelmholtz-Institut Mainz | Mainz | Rheinland-Pfalz | 2009 | |
| ForschungsinstitutHelmholtz-Institut MünsterHI MS | Münster | Nordrhein-Westfalen | — | |
| Hochschulnahe EinrichtungHessische Staatsdomäne Frankenhausen | Grebenstein | Hessen | — | |
| LandeseinrichtungHessisches Institut für Landesgeschichte | Marburg | Hessen | 1920 | |
| ForschungsinstitutHessisches Wirtschaftsarchiv | Darmstadt | Hessen | 1992 | |
| ForschungsinstitutHölderlin-Archiv | Stuttgart | Baden-Württemberg | 1941 | |
 ForschungsinstitutHornemann Institut | Hildesheim | Niedersachsen | 1998 | |
| Gemeinnütziges InstitutICM Chemnitz | Chemnitz | Sachsen | 1992 | |
| ForschungsinstitutIFA DGUV | Sankt Augustin | Nordrhein-Westfalen | 1935 | |
| Forschungsinstitutifh Göttingen (Volkswirtschaftliches Institut für Mittelstand und Handwerk) | Göttingen | Niedersachsen | — | |
| Gemeinnütziges InstitutIfM - Institut für Musikinstrumentenbau e.V. | Klingenthal | Sachsen | — | |
| ForschungsinstitutIfM – Small and Medium Sized Companies and Entrepreneurship | Mannheim | Baden-Württemberg | 1987 | |
| ForschungsinstitutIFT Institut für Therapieforschung | München | Bayern | 1973 | |
| ForschungsinstitutIGB Neuglobsow | Stechlin | Brandenburg | — | |
| Gemeinnütziges InstitutIKT – Institut für Unterirdische InfrastrukturIKT | Gelsenkirchen | Nordrhein-Westfalen | 1994 | |
 DenkfabrikInitiative Neue Soziale MarktwirtschaftINSM | Berlin | Berlin | 2000 | |
| DenkfabrikInstitut Arbeit und Technik | Gelsenkirchen | Nordrhein-Westfalen | 1988 | |
 Hochschulnahe EinrichtungInstitut Arbeit und Wirtschaft | Bremen | Bremen | — | |
 DenkfabrikInstitut der deutschen Wirtschaft | Köln | Nordrhein-Westfalen | 1951 | |
 ForschungsinstitutInstitut Deutsche Adelsforschung | Kiel | Schleswig-Holstein | 1993 | |
 ForschungsinstitutInstitut für angewandte Arbeitswissenschaft | Düsseldorf | Nordrhein-Westfalen | 1962 | |
 An-InstitutInstitut für Angewandte Bauforschung WeimarIAB | Weimar | Thüringen | — | |
 Gemeinnütziges InstitutInstitut für angewandte Forschung Berlin | Berlin | Berlin | 2009 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Angewandte Informatik | Leipzig | Sachsen | 2006 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Angewandte Informatik und Formale BeschreibungsverfahrenAIFB | Karlsruhe | Baden-Württemberg | — | |
| ForschungsinstitutInstitut für Angewandte Photophysik Dresden | Dresden | Sachsen | 1908 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Angewandte TrainingswissenschaftIAT | Leipzig | Sachsen | 1992 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Angewandte Wirtschaftsforschung | Tübingen | Baden-Württemberg | 1957 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Arbeit und Gesundheit der Deutschen Gesetzlichen Unfallversicherung | Dresden | Sachsen | — | |
 ForschungsinstitutInstitut für Arbeitsmarkt- und BerufsforschungIAB | Nürnberg | Bayern | 1967 | |
 Gemeinnütziges InstitutInstitut für Automation und Kommunikation | Magdeburg | Sachsen-Anhalt | 1991 | |
| ForschungsinstitutInstitut für bakterielle Infektionen und Zoonosen | Jena | Thüringen | — | |
| ForschungsinstitutInstitut für Bienenkunde und Imkerei | Veitshöchheim | Bayern | 1907 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Bildungsanalysen Baden-WürttembergIBBW | Stuttgart | Baden-Württemberg | 2019 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Biomedizinische Technik | Karlsruhe | Baden-Württemberg | — | |
 ForschungsinstitutInstitut für Datenwissenschaften | Jena | Thüringen | — | |
| DenkfabrikInstitut für den öffentlichen Sektor | Berlin | Berlin | 2005 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Dokumentologie und Editorik | Berlin | Berlin | 2006 | |
 LandeseinrichtungInstitut für donauschwäbische Geschichte und Landeskunde | Tübingen | Baden-Württemberg | 1987 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Epidemiologie (Greiswald) | Greifswald | Mecklenburg-Vorpommern | — | |
| DenkfabrikInstitut für Europäische PolitikIEP | Berlin | Berlin | 1959 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Forschung und Entwicklung von SportgerätenFES | Berlin | Berlin | 1962 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für Forschungsinformation und Qualitätssicherung | Berlin | Berlin | 2005 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für Gerontologische Forschung | Berlin | Berlin | 1985 | |
| LandeseinrichtungInstitut für Geschichtliche Landeskunde Rheinland-Pfalz | Mainz | Rheinland-Pfalz | 1960 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Hochenergiephysik (Zeuthen) | Zeuthen | Brandenburg | — | |
 ForschungsinstitutInstitut für Holztechnologie Dresden | Dresden | Sachsen | 1952 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Immunologie | Tübingen | Baden-Württemberg | 1952 | |
| An-InstitutInstitut für Implantattechnologie und BiomaterialienIIB | Rostock | Mecklenburg-Vorpommern | 1996 | |
 ForschungsinstitutInstitut für industrielle Informationstechnik | Lemgo | Nordrhein-Westfalen | 2006 | |
 ForschungsinstitutInstitut für Informationssysteme (Hochschule Hof) | Hof | Bayern | 2010 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Kraftfahrzeuge Aachen | Aachen | Nordrhein-Westfalen | — | |
| ForschungsinstitutInstitut für Kulturanalyse der Deutschen des östlichen Europa | Freiburg im Breisgau | Baden-Württemberg | 1951 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Landschaftsökologie und Naturschutz (ILN) - NABU-Waldinstitut in Bühl | Bühl | Baden-Württemberg | — | |
| ForschungsinstitutInstitut für Lasertechnologien in der Medizin und Meßtechnik | Ulm | Baden-Württemberg | 1985 | |
 Gemeinnütziges InstitutInstitut für Luft- und KältetechnikILK | Dresden | Sachsen | 1990 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Mechanische Verfahrenstechnik und MechanikMVM | Karlsruhe | Baden-Württemberg | — | |
 DenkfabrikInstitut für Medien- und Kommunikationspolitik | Köln | Nordrhein-Westfalen | 2005 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Meereskunde der Universität Hamburg | Hamburg | Hamburg | — | |
| BundeseinrichtungInstitut für Mikrobiologie der BundeswehrInstMikroBioBw | München | Bayern | 1984 | |
 ForschungsinstitutInstitut für Mikroelektronik Stuttgart | Stuttgart | Baden-Württemberg | 1983 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für Molekulare Biologie | Mainz | Rheinland-Pfalz | 2010 | |
| ForschungsinstitutInstitut für molekulare Pathogenese | Jena | Thüringen | — | |
| ForschungsmuseumInstitut für Museumsforschung | Berlin | Berlin | 1979 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Ökonomische Bildung | Oldenburg | Niedersachsen | — | |
| ForschungsinstitutInstitut für ParlamentarismusforschungIParl | Berlin | Berlin | 2016 | |
| BundeseinrichtungInstitut für Pharmakologie und Toxikologie der BundeswehrInstPharmToxBw | München | Bayern | — | |
| ForschungsinstitutInstitut für Politische Wissenschaft Erlangen | Erlangen | Bayern | 1961 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Protest- und Bewegungsforschung | Berlin | Berlin | 2012 | |
| BundeseinrichtungInstitut für Radiobiologie der BundeswehrInstRadBioBw | München | Bayern | — | |
 ForschungsinstitutInstitut für Rebenzüchtung Geilweilerhof | Siebeldingen | Rheinland-Pfalz | — | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für Sächsische Geschichte und VolkskundeISGV | Dresden | Sachsen | 1997 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Seenforschung | Langenargen | Baden-Württemberg | 1970 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Softwaremethoden zur Produkt-Virtualisierung | Dresden | Sachsen | 2017 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Solare Energieversorgungstechnik | Kassel | Hessen | 1988 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Solarenergieforschung | Hameln | Niedersachsen | — | |
 DenkfabrikInstitut für sozial-ökologische ForschungISOE | Frankfurt am Main | Hessen | 1989 | |
 Gemeinnütziges InstitutInstitut für Sozialforschung | Frankfurt am Main | Hessen | 1923 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Technik der InformationsverarbeitungITIV | Karlsruhe | Baden-Württemberg | — | |
| ForschungsinstitutInstitut für Technikfolgenabschätzung und SystemanalyseITAS | Karlsruhe | Baden-Württemberg | 1995 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Transurane | Karlsruhe | Baden-Württemberg | — | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für Umwelt & Energie, Technik & AnalytikIUTA | Duisburg | Nordrhein-Westfalen | 1989 | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für UnternehmenskybernetikIfU | Aachen | Nordrhein-Westfalen | 1988 | |
| DenkfabrikInstitut für Unternehmerische Freiheit | Berlin | Berlin | 2006 | |
| ForschungsinstitutInstitut für vergleichende Städtegeschichte | Münster | Nordrhein-Westfalen | 1970 | |
| ForschungsinstitutInstitut für VerkehrswesenIFV | Karlsruhe | Baden-Württemberg | — | |
| ForschungsinstitutInstitut für Vogelforschung „Vogelwarte Helgoland“ | Wilhelmshaven | Niedersachsen | 1910 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Wasser und Boden | Dresden | Sachsen | 2001 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Werkstoff-Forschung | Köln | Nordrhein-Westfalen | — | |
| Gemeinnütziges InstitutInstitut für ZukunftsEnergieSysteme | Saarbrücken | Saarland | 1999 | |
| ForschungsinstitutInstitut für Zukunftsstudien und TechnologiebewertungIZT | Berlin | Berlin | 1981 | |
| ForschungsinstitutInstitut Hochfeld-Magnetlabor Dresden | Dresden | Sachsen | — | |
| An-InstitutInstitut Kirche und Judentum | Berlin | Berlin | 1960 | |
 DenkfabrikInstitut Solidarische ModerneISM | Berlin | Berlin | 2010 | |
| Hochschulnahe EinrichtungInstitut Technik und Bildung | Bremen | Bremen | — | |
| ForschungsinstitutInstitut Wohnen und Umwelt | Darmstadt | Hessen | 1971 | |
| An-InstitutInstitut zur Qualitätsentwicklung im BildungswesenIQB | Berlin | Berlin | 2004 | |
| ForschungsinstitutInstitute for Law and Finance | Frankfurt am Main | Hessen | 2002 | |
| ForschungsinstitutInstitute of Food Science and Biotechnology | Stuttgart | Baden-Württemberg | — | |
| ForschungsinstitutInstitute of Medical and Pharmaceutical Chemistry | Braunschweig | Niedersachsen | — | |
| Hochschulnahe EinrichtungInstitutum Judaicum Delitzschianum | Münster | Nordrhein-Westfalen | — | |
| Hochschulnahe EinrichtungIntelligent Machine-Brain Interfacing TechnologyIMBIT | Freiburg im Breisgau | Baden-Württemberg | — | |
| Forschungsmuseuminter media art institute | Düsseldorf | Nordrhein-Westfalen | 2006 | |
| Denkfabrikinterface | Berlin | Berlin | 2008 | |
| ForschungsinstitutInternational Data SpacesIDSA | Dortmund | Nordrhein-Westfalen | 2016 | |
| Hochschulnahe EinrichtungInternational Graduate Centre for the Study of Culture | Gießen | Hessen | 2007 | |
| ForschungsinstitutInternationales Forschungs- und Dokumentationszentrum Kriegsverbrecherprozesse | Marburg | Hessen | — | |
| ForschungsinstitutInternationales Institut für Sozio-Informatik | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 2000 | |
 ForschungsinstitutInternationales Zentrum für Wasserressourcen und Globalen WandelICWRGC | Koblenz | Rheinland-Pfalz | 2014 | |
| Gemeinnütziges InstitutISF München | München | Bayern | 1965 | |
| An-InstitutIWW Zentrum WasserIWW | Mülheim an der Ruhr | Nordrhein-Westfalen | 1986 | |
 ForschungsinstitutIZOP-Institut | Aachen | Nordrhein-Westfalen | 1969 | |
| ForschungsinstitutJülich Supercomputing Centre (JSC) | Jülich | Nordrhein-Westfalen | — | |
 BundeseinrichtungJulius Kühn-InstitutJKI | Quedlinburg | Sachsen-Anhalt | 2008 | |
| ForschungsinstitutJulius Wolff InstituteJWI | Berlin | Berlin | 2008 | |
| DenkfabrikKartoffelkombinat – der Verein e. V. | München | Bayern | 2016 | |
| Hochschulnahe EinrichtungKäte Hamburger Kolleg/Centre for Global Cooperation ResearchKHK | Duisburg | Nordrhein-Westfalen | 2012 | |
| ForschungsinstitutKIST Europe | Saarbrücken | Saarland | 1996 | |
| DenkfabrikKnowmad Institut | Joachimsthal | Brandenburg | 2018 | |
| ForschungsinstitutKommission für Alte Geschichte und Epigraphik | München | Bayern | 1951 | |
| ForschungsinstitutKommission für Archäologie Außereuropäischer Kulturen | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1979 | |
| Gemeinnütziges InstitutKommission für Geschichte des Parlamentarismus und der politischen Parteien | Berlin | Berlin | 1951 | |
 ForschungsinstitutKompetenzzentrum – Trier Center for Digital Humanities | Trier | Rheinland-Pfalz | 1998 | |
| Gemeinnütziges InstitutKonsortium Deutsche Meeresforschung | Berlin | Berlin | 2004 | |
 Gemeinnütziges InstitutKulturstiftung Sibirien | Fürstenberg/Havel | Brandenburg | 2010 | |
| ForschungsinstitutKVB Institut für Konstruktion und Verbundbauweisen | Döbeln | Sachsen | 1994 | |
 ForschungsinstitutL3S | Hannover | Niedersachsen | 2001 | |
| ForschungsinstitutLabLab UG | Leipzig | Sachsen | — | |
| Hochschulnahe EinrichtungLabor für Geoinformatik | Mainz | Rheinland-Pfalz | 2021 | |
| ForschungsinstitutLamarr-Institut | Sankt Augustin | Nordrhein-Westfalen | 2022 | |
| ForschungsinstitutLänderinstitut für Bienenkunde | Hohen Neuendorf | Brandenburg | 1923 | |
| LandeseinrichtungLandesanstalt für Pflanzenbau | Rheinstetten | Baden-Württemberg | — | |
| ForschungsinstitutLandwirtschaftliches Technologiezentrum Augustenberg | Karlsruhe | Baden-Württemberg | 2007 | |
| Gemeinnütziges InstitutLaser-Laboratorium Göttingen | Göttingen | Niedersachsen | 1987 | |
| Gemeinnütziges InstitutLaser Zentrum Hannover | Hannover | Niedersachsen | 1986 | |
| Hochschulnahe EinrichtungLateinamerika-Institut | Berlin | Berlin | 1970 | |
| Gemeinnütziges InstitutLehr- und Versuchsanstalt für Gartenbau und Arboristik e.V. - Obstbau-Versuchsstation Müncheberg | Müncheberg | Brandenburg | — | |
| Gemeinnütziges InstitutLeibniz-Institut für Medienforschung | Hans-Bredow-Institut (HBI) | Hamburg | Hamburg | 1950 | |
| ForschungsinstitutLeibniz-Zentrum Allgemeine SprachwissenschaftZAS | Berlin | Berlin | 1996 | |
| ForschungsinstitutLeibniz-Zentrum für Literatur- und Kulturforschung | Berlin | Berlin | 1996 | |
| Hochschulnahe EinrichtungLeichtweiß-Institut | Braunschweig | Niedersachsen | 1939 | |
| Akademie-InstitutLessing-Akademie | Wolfenbüttel | Niedersachsen | 1971 | |
| ForschungsinstitutMannheimer Zentrum für Europäische Sozialforschung | Mannheim | Baden-Württemberg | 1989 | |
| ForschungsinstitutMARUM | Bremen | Bremen | 2001 | |
| ForschungsinstitutMax-Planck-Institut für biologische IntelligenzMPI-BI | Planegg | Bayern | 2023 | |
| ForschungsinstitutMax-Planck-Institut für Innovation und Wettbewerb | München | Bayern | 1952 | |
| ForschungsinstitutMax-Planck-Institut für Neurobiologie des Verhaltens – caesarMPI-INB | Bonn | Nordrhein-Westfalen | — | |
| Gemeinnütziges InstitutMax-Reger-Institut | Karlsruhe | Baden-Württemberg | — | |
 BundeseinrichtungMax Rubner-InstitutMRI | Karlsruhe | Baden-Württemberg | 2004 | |
| ForschungsinstitutMax von Pettenkofer-Institut | München | Bayern | — | |
| Gemeinnütziges InstitutMedizinische Enzym- Forschungs-Gesellschaft e.V. | Grassau | Bayern | — | |
| DenkfabrikMercator Institute for China StudiesMERICS | Berlin | Berlin | 2013 | |
| ForschungsinstitutMercator Research Institute on Global Commons and Climate Change | Berlin | Berlin | 2012 | |
| ForschungsinstitutMichael-Otto-Institut | Bergenhusen | Schleswig-Holstein | — | |
| ForschungsinstitutMikroskopie im Nanometerbereich und Molekularphysiologie des Gehirns Exzellenzcluster 171 — DFG Forschungszentrum 103 | Göttingen | Niedersachsen | 2002 | |
| Gemeinnütziges InstitutModellfabrik Papier | Düren | Nordrhein-Westfalen | 2021 | |
| ForschungsinstitutMonumenta Germaniae HistoricaMGH | München | Bayern | 1819 | |
| ForschungsinstitutMoses Mendelssohn Zentrum für europäisch-jüdische Studien | Potsdam | Brandenburg | 1992 | |
| Hochschulnahe EinrichtungMunich Center for Mathematical PhilosophyMCMP | München | Bayern | — | |
| DenkfabrikMunich Climate Insurance InitiativeMCII | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 2005 | |
| ForschungsinstitutNAKO Gesundheitsstudie, Studienzentrum Hannover | Hannover | Niedersachsen | — | |
| ForschungsinstitutNiedersächsisches Institut für frühkindliche Bildung und Entwicklung | Osnabrück | Niedersachsen | — | |
| ForschungsinstitutNiedersächsisches Institut für historische Küstenforschung | Wilhelmshaven | Niedersachsen | 1938 | |
| ForschungsinstitutNiedersächsisches Zentrum für Biomedizintechnik, Implantatforschung und -entwicklung | Hannover | Niedersachsen | 2008 | |
| ForschungsinstitutNMI Naturwissenschaftliches und Medizinisches Institut | Reutlingen | Baden-Württemberg | — | |
| An-InstitutNordfriisk Instituut | Bredstedt | Schleswig-Holstein | 1964 | |
| Hochschulnahe EinrichtungNordost-InstitutIKGN e. V. | Lüneburg | Niedersachsen | 2002 | |
| ForschungsinstitutNordwestdeutsche Forstliche Versuchsanstalt | Göttingen | Niedersachsen | 1950 | |
 ForschungsinstitutNRW School of Governance | Duisburg | Nordrhein-Westfalen | 2006 | |
 ForschungsmuseumNS-Dokumentationszentrum der Stadt Köln | Köln | Nordrhein-Westfalen | 1987 | |
 Gemeinnütziges InstitutNürnberg Institut für Marktentscheidungen | Nürnberg | Bayern | 1934 | |
| ForschungsinstitutOFFIS – Institut für Informatik | Oldenburg | Niedersachsen | 1991 | |
| DenkfabrikÖko-Institut | Freiburg im Breisgau | Baden-Württemberg | 1977 | |
| ForschungsinstitutOrff-Zentrum München Staatsinstitut für Forschung und Dokumentation | München | Bayern | — | |
| ForschungsinstitutOsteuropa-Institut | Berlin | Berlin | — | |
| ForschungsinstitutOstkirchliches Institut Regensburg | Regensburg | Bayern | 1962 | |
| Hochschulnahe EinrichtungOtto-Suhr-Institut | Berlin | Berlin | 1959 | |
 ForschungsinstitutOzean der Zukunft | Kiel | Schleswig-Holstein | 2006 | |
| ForschungsinstitutPaderborn Center for Parallel ComputingPC2 | Paderborn | Nordrhein-Westfalen | 1991 | |
| Forschungsinstitutpaläon Forschungsmuseum | Schöningen | Niedersachsen | — | |
| Gemeinnütziges InstitutParmenides Foundation | Pöcking | Bayern | 2000 | |
 BundeseinrichtungPaul-Ehrlich-InstitutPEI | Langen | Hessen | 1896 | |
| ForschungsinstitutPestel Institut | Hannover | Niedersachsen | 1968 | |
| ForschungsinstitutPeter-Szondi-Institut | Berlin | Berlin | 1965 | |
 BundeseinrichtungPhysikalisch-Technische BundesanstaltPTB | Braunschweig | Niedersachsen | 1887 | |
| ForschungsinstitutPilecki Institut Berlin | Berlin | Berlin | 2019 | |
 DenkfabrikProgressives Zentrum | Berlin | Berlin | 2007 | |
| ForschungsinstitutPsychologisches Institut Tübingen | Tübingen | Baden-Württemberg | — | |
 An-InstitutRachel Carson Center for Environment and Society | München | Bayern | 2009 | |
| ForschungsinstitutRathgen-Forschungslabor | Berlin | Berlin | — | |
| DenkfabrikRepublik21 | München | Bayern | 2021 | |
 BundeseinrichtungRobert Koch-InstitutRKI | Berlin | Berlin | 1891 | |
 DenkfabrikRoman-Herzog-Institut | München | Bayern | 2002 | |
| ForschungsinstitutRostocker Zentrum zur Erforschung des Demografischen Wandels | Rostock | Mecklenburg-Vorpommern | 2004 | |
| ForschungsinstitutRudolf-Virchow-Zentrum | Würzburg | Bayern | 2002 | |
 Akademie-InstitutSächsische Akademie der Wissenschaften | Leipzig | Sachsen | 1846 | |
| ForschungsinstitutSchweißtechnische Lehr- und Versuchsanstalt | Halle (Saale) | Sachsen-Anhalt | 1999 | |
| ForschungsinstitutSenckenberg am Meer | Wilhelmshaven | Niedersachsen | 1928 | |
| ForschungsinstitutSenckenberg Biodiversität und Klima Forschungszentrum | Frankfurt am Main | Hessen | 2008 | |
| ForschungsmuseumSenckenberg Naturhistorische Sammlungen Dresden | Dresden | Sachsen | — | |
| ForschungsinstitutSHARE BERLIN InstituteSBI | Berlin | Berlin | 2022 | |
| ForschungsinstitutSigmund-Freud-Institut | Frankfurt am Main | Hessen | 1960 | |
| Hochschulnahe EinrichtungSoziologisches Forschungsinstitut Göttingen | Göttingen | Niedersachsen | 1968 | |
| ForschungsinstitutSpeinshart Scientific Center for AI and SuperTech | Speinshart | Bayern | — | |
| LandeseinrichtungStaatliche Lehr- und Versuchsanstalt für Wein- und Obstbau Weinsberg | Weinsberg | Baden-Württemberg | 1868 | |
| LandeseinrichtungStaatliches Institut für MusikforschungSIM | Berlin | Berlin | 1935 | |
| LandeseinrichtungStaatliches Weinbauinstitut Freiburg | Freiburg im Breisgau | Baden-Württemberg | 1920 | |
 Gemeinnütziges InstitutStudiengesellschaft für den Kombinierten VerkehrSGKV | Berlin | Berlin | 1928 | |
| ForschungsinstitutStudiengesellschaft für unterirdische Verkehrsanlagen | Köln | Nordrhein-Westfalen | 1960 | |
| Hochschulnahe EinrichtungSüdasien-Institut Heidelberg | Heidelberg | Baden-Württemberg | 1962 | |
 Gemeinnütziges InstitutSüdwind-Institut | Bonn | Nordrhein-Westfalen | 1991 | |
| Gemeinnütziges InstitutSylvia Lawry Centre for MS Research e.V. | München | Bayern | 2001 | |
| ForschungsinstitutTaktikzentrum des HeeresTZH | Dresden | Sachsen | 1980 | |
| ForschungsinstitutTechnologie-Transfer-Zentrum | Bremerhaven | Bremen | 1987 | |
| ForschungsinstitutTechnologie- und Förderzentrum (Bayern) | Straubing | Bayern | 2002 | |
| ForschungsinstitutTechnologiezentrum Halbleitermaterialien | Freiberg | Sachsen | 2005 | |
| ForschungsinstitutTecO | Karlsruhe | Baden-Württemberg | 1993 | |
| An-InstitutTestDaF-Institut | Bochum | Nordrhein-Westfalen | 2001 | |
| DenkfabrikThink Tank Digitalisierung | Braunschweig | Niedersachsen | — | |
| ForschungsinstitutThüringer Zentrum für Maschinenbau | Ilmenau | Thüringen | 2013 | |
| DenkfabrikTönissteiner Kreis | Berlin | Berlin | 1958 | |
| ForschungsinstitutTranslationszentrum für Regenerative Medizin Leipzig | Leipzig | Sachsen | 2006 | |
| Hochschulnahe EinrichtungTrierer Papyrussammlung | Trier | Rheinland-Pfalz | 1982 | |
| ForschungsinstitutTUM Institute for Advanced Study | Garching bei München | Bayern | — | |
| Hochschulnahe EinrichtungTUM School of Life SciencesWZW | Freising | Bayern | 2000 | |
| Hochschulnahe EinrichtungUNU-FLORES | Dresden | Sachsen | 2012 | |
 ForschungsinstitutUSUMA | Berlin | Berlin | 1990 | |
 Gemeinnütziges InstitutVerein zur Förderung eines Deutschen ForschungsnetzesDFN | Berlin | Berlin | 1984 | |
 Gemeinnütziges InstitutVersuchs- und Lehranstalt für BrauereiVLB | Berlin | Berlin | 1883 | |
| ForschungsinstitutWalo I | Bomlitz | Niedersachsen | — | |
| DenkfabrikWalter Eucken Institut | Freiburg im Breisgau | Baden-Württemberg | 1954 | |
| Hochschulnahe EinrichtungWalter Schottky Institut | Garching bei München | Bayern | 1986 | |
| ForschungsinstitutWalther-Meißner-Institut für TieftemperaturforschungWMI | Garching bei München | Bayern | — | |
| ForschungsinstitutWalther-Schücking-Institut für internationales Recht | Kiel | Schleswig-Holstein | 1914 | |
 BundeseinrichtungWehrwissenschaftliches Institut für Schutztechnologien – ABC-SchutzWIS | Munster | Niedersachsen | 1958 | |
| Gemeinnütziges InstitutWeizenbaum-Institut | Berlin | Berlin | 2017 | |
| Gemeinnütziges InstitutWilhelm-Röpke-Institut | Erfurt | Thüringen | 2007 | |
| Hochschulnahe EinrichtungWilhelm-Schickard-Institut | Tübingen | Baden-Württemberg | — | |
 Hochschulnahe EinrichtungWilly Brandt School of Public Policy | Erfurt | Thüringen | 2002 | |
| ForschungsinstitutWissenschaftskolleg zu Berlin | Berlin | Berlin | 1981 | |
 Gemeinnütziges InstitutWuppertal Institut für Klima, Umwelt, Energie | Wuppertal | Nordrhein-Westfalen | 1990 | |
| DenkfabrikYoung Initiative on Foreign Affairs and International Relations | Berlin | Berlin | 2010 | |
| An-InstitutZacharias Frankel College | Potsdam | Brandenburg | 2013 | |
 Hochschulnahe EinrichtungZARM | Bremen | Bremen | — | |
| BundeseinrichtungZentralinstitut für die kassenärztliche Versorgung in der Bundesrepublik Deutschland | Berlin | Berlin | 1973 | |
| ForschungsinstitutZentrum für Historische Forschung Berlin | Berlin | Berlin | 2006 | |
| ForschungsinstitutZentrum für Informationsdienste und HochleistungsrechnenZIH | Dresden | Sachsen | 2005 | |
| ForschungsinstitutZentrum für interdisziplinäre Forschung | Bielefeld | Nordrhein-Westfalen | 1968 | |
| Gemeinnütziges InstitutZentrum für Osteuropa- und internationale StudienZOiS | Berlin | Berlin | 2016 | |
| ForschungsinstitutZentrum für Populäre Kultur und Musik | Freiburg im Breisgau | Baden-Württemberg | — | |
| ForschungsinstitutZentrum für Regenerative Therapien DresdenCRTD | Dresden | Sachsen | 2006 | |
| ForschungsinstitutZentrum für Sonnenenergie- und Wasserstoff-Forschung Baden-Württemberg | Ulm | Baden-Württemberg | 1988 | |
| ForschungsinstitutZentrum für Sozialforschung Halle | Halle (Saale) | Sachsen-Anhalt | 1995 | |
| ForschungsinstitutZentrum für Systembiologie Dresden | Dresden | Sachsen | — | |
 DenkfabrikZentrum Liberale Moderne | Berlin | Berlin | 2017 | |
| ForschungsinstitutZoologische Staatssammlung München | München | Bayern | 1807 | |
| ForschungsinstitutZuse-Institut BerlinZIB | Berlin | Berlin | 1984 | |